Podczas pracy na wschodzie kraju, widział Skarga spustoszenie duchowe wywołane rosnącymi wpływami reformacji. Wobec nieustannych świętokradzkich ataków na Najświętszy Sakrament ze strony protestantów Skarga coraz mocniej okazywał swoją wielką cześć dla Eucharystii. W Wilnie założył Bractwo Najświętszego Sakramentu. Z tego powodu był obiektem częstych bezpośrednich ataków na jego osobę. Doświadczył tego m.in. w Rydze. "To miasto jakby się sprzysięgło trwać uporczywie przy swojej herezji[...] bowiem do tego doszło, że mię o mało nie przebito w kościele”. Kazania i pisma Skargi, zwalczające z olbrzymią gorliwością herezje, stawały się przyczyną wyzwisk i kłamliwych oskarżeń. Okres wileński trwał jedenaście lat, po czym ks. Skarga przybył do Krakowa, gdzie założył Bractwo Miłosierdzia oraz tzw. Bank Pobożny, który miał wyrywać biedaków z długów i lichwy. Za swoją pobożność ks. Piotr został nagrodzony. Pewnego razu gdy odprawiał Mszę Świętą przed cudownym wizerunkiem Chrystusa Ukrzyżowanego w podkrakowskiej Mogile, Chrystus Pan przemówił do niego z krzyża, a cztery lata przed swoją śmiercią, w trakcie odprawiania Mszy św. miał widzenie niezwykłego światła jaśniejącego wokół Najświętszego Sakramentu. Jak opowiadał, usłyszał wtedy głos: "Daję ci zadatek miłości mojej ku tobie. Przyjmuję cię w jedność ciała mego, abyś był częścią moją nierozdzielną. Czynie cię uczestnikiem dziedzictwa mojego".
Król Zygmunt III Waza powołał go w roku 1588 na nadwornego kaznodzieję i te obowiązki ks. Piotr Skarga wypełniał przez dwadzieścia trzy lata, najpierw w Krakowie, a później (po przeniesieniu stolicy) w Warszawie. Z tym okresem właśnie związane są jego słynne „Kazania sejmowe” głoszone dla posłów, ale adresowane do całego narodu. Nie należą one do literatury religijnej, lecz są doskonale ułożonym traktatem politycznym o przebudowie państwa polskiego. Jako katolik i patriota Piotr Skarga walczył o przywrócenie jedności religijnej w Polsce, wzmocnienie władzy królewskiej oraz usunięcie krzywd społecznych i praw niesprawiedliwych. Osiem "Kazań sejmowych" to osiem rozdziałów rozprawy politycznej o najważniejszych niedomaganiach Rzeczypospolitej, o sposobach ich przezwyciężania. Zwracał w nich uwagę na szczególną odpowiedzialność posłów katolickich za jakość stanowionego prawa.
Na początku września 1612 r. ks. Piotr Skarga zaniemógł, nie mógł już odprawiać Mszy Świętej, a jedynie codziennie przyjmował Komunię Świętą. Zmarł po przyjęciu olei św. i Komunii Świętej, w dniu 27 września 1612 r.
S.D. /Na podstawie portalu Gery.pl/